東南アジアでは、域内各国の協力関係が進展する一方で、依然として不安定要素も存在している。
　08(同20)年7月、プレアビヒア寺院周辺の国境未画定地域の扱いをめぐり、カンボジアとタイとの間で緊張が高まり、同年10月には対峙していた両国軍の間で銃撃戦が発生し、双方に死傷者が発生する事態に至った。その後は、両国の現地軍司令官が協議を行い、同寺院周辺で共同パトロールを行うことで合意し、事態の解決が試みられているが、これまで両国軍の間で散発的に銃撃戦が発生している。
　フィリピンでは、政府とイスラム系反政府勢力のモロ・イスラム解放戦線(MILF：Moro Islamic Liberation Front)が約40年にわたり武力衝突を繰り返してきたが、03(同15)年の停戦合意、04(同16)年からの国際監視団(IMT：International Monitoring Team)¹の活動により、和平プロセスが進展した。しかし、08(同20)年8月以降、懸案であった土地問題解決をめぐり武力衝突が再び激化し、主要メンバーであるマレーシアがIMTから撤退したため、同年11月末にIMTは活動を中止した。その後、同年12月に、フィリピン政府とMILFは、IMTを再結成することで合意し、和平合意に向けた交渉が再開した。これを受け、10(同22)年2月にはわが国およびマレーシアがIMTに要員を再派遣し、IMTは正式にミンダナオ島での活動を再開した²。今後、ミンダナオ和平の最終合意が早期に達成することが望まれる³。
　東ティモールでは、06(同18)年4月の治安悪化を受け、オーストラリア、ニュージーランド、ポルトガル、マレーシアの4か国が国際治安部隊(ISF：International Stabilisation Force)を現地に派遣し⁴、同年8月には、国連東ティモール統合ミッション(UNMIT：United Nations Integrated Mission in Timor-Leste)が設立された⁵。
　08(同20)年2月、ラモス・ホルタ大統領およびグスマン首相に対する武装勢力による襲撃事件が発生したものの、その後、安定化に向けた政治的・経済的努力が続けられ、現在、治安情勢は安定している。しかし、国家誕生間もない東ティモールの平和と安定、発展を促進する観点から、同ミッションが重要であるとの認識の下、UNMITのマンデートは来年2月26日まで延長された。なお、東ティモールは12(同24)年までのASEAN加盟を目標としている。